Prema spisima povjesničara Afanasievskiy Jaroslavlj Samostan je osnovan nakon 1612. godine, u vrijeme kada je pored crkve Atanazija i Ćirila bio u kapeli stjecanja čudotvornom ikonom Spasitelja našega. Ali postoji pisani dokaz da je samostan već postojao u 16. stoljeću. U 1615., Gabriel Myakushkin, okružni načelnik, upitani metropolit Kirill Rostov blagosloviti temelje samostana na svetome mjestu.

Postoji pisani dokaz da su Athanasian samostan opati vladao. U prvim godinama svog postojanja, već je dobio u posjed povelja i povlastica Mihail Fedorovich. Prvi pismenosti, koja datira iz 1619., rekao je da je samostan Athanasian izuzeti od rugi novca i kruha, svijeće, vino, na svojim zadnjih nogu. Također, samostan je dodijeljen mjesto u mlinu na strani Romanov i Yaroslavl. Uz drvo i drvo, koji je nosio samostan na Volgi, Mologa i Sheksna odnose na redovničkim dužnostima naplaćuje se. Samostan oslobođeni smještaj takvog guvernera, plemići, knezovi i vojnika.

Prve zgrade samostana su drvene, u 17. stoljeću. prebivalište više puta spaljeni tijekom požara. Na primjer, u 1658. samostan je spaljen do temelja. Prvi kamen crkva samostana u čast Atanazija i Ćirila sagrađena 1664. godine uz blagoslov Metropolitan Jone za Rostov Sysoevicha. Po završetku, crkva je ukrašen slikama, od strane Moskvi majstora. Tijekom požara u 1670. samostan je ponovno pretrpio. U 1676. sagrađena katedrala na sjeveru zimski crkvu sa zvonikom, koja je posvećena u čast mitropolit Moskve opisao Alexy. U 1736., na zahtjev opata samostana Jone i dekretom nadbiskupa Jojakima pripisati Afanasyevsky samostan kapeli vezan za njegov ili Znamenskaia Vlasievskaya Tower, što je ulazna vrata na zemljanom gradu. Danas je poznat kao Znamenskaya Crkve.

Afanasievskiy Manastir significant've nikada nije bio u bogatstvu svojih posjeda, odnosno od broja redovnika: 1717. živio samo sedam redovnika, ali jedan Belec; osoblje nije povećao, a prema 1802 teritorija samostana bio je vrlo mala, ona je ograničena na niskom kamenom zidu samo na istoku i sjeveroistoku. S druge strane ograde kao samostanskim gospodarske zgrade su ograničenost kuće, kao i crkva Spasitelja Proboinskaya.

ET, prednje pročelje samostana, koji je na break-out, u 18. stoljeću. Dvije kamene kule podignuta mala veličina, jedan od njih je odigrao ulogu Svete Gate, koji se nalazi u drugoj kapeli u čast važan događaj - utvrđenjem čudotvorna ikona ovdje. Toranj tornjevima završio s likovima trubi anđela.

25. lipnja 1768 u centru Yaroslavl, ponovno je došlo do požara. Popis je sadržavao štetu, naime, prvi opis samostanskih zgrada Athanasian. Tijekom restauratorskih radova je ažuriran na platnu hram Atanazije i Ćirila, izvorni kameni ikonostas zamijenjen s drvenom jedan.

U 1820-1830 GG. u samostanu su provedena u velikim rad na njegovo poboljšanje: tu su podignuta dva storeyed kamena opatov četvrtine s blagovaonici; Nastale su dvije sestrinske stanice; za Crkvu Atanazija i Ćirila 1825. obrtnik Konstantina misala proizvedene na svoj trošak novi ikonostasa, Aleksandar Charyshnikov od Yaroslavl ga pozlaćenim; 1831., hram je ukrašen toplim slikama, zidne izvršiti Timothy Medvedev. U isto vrijeme, jednog kata zvonika je obnovljena na trijemu toplom crkvi samostana ukinuta župna Borisoglebskii je prebačen u 115-pud zvono. Ansambl samostana zvoniku sedam zvona.

Sljedeći operacije Afanasievskiy Samostan je na prijelazu iz 19-20 stoljeća: 1897. godine su građene od kamena podruma, trener, staje, kupelji, staje;. 1903. i 1907. godine. obavlja popravak rad u katedrali crkvi sredstava dodijeljenih FE Vakhrameev; 1912. bio ponovlena slikar i restaurator mural MI Dikareva o donacijama AI Vakhromeeva.

U 1764. po naredbi carice Katarine II samostan Afanasievskiy rangiran kao nevažno. 12. prosinca, 1857 Afanasyevskaya Samostan je sagrađen u stupanj treteklassnoy, njezini nadređeni imali od tog vremena u činu arhimandrit. Od 1895. Afanasievskiy samostan dobila status prebivališta vikar biskupa biskupije Yaroslavl.

Nakon revolucije, kada je samostan osnovan Afanasyevsky župnu zajednicu. U veljači 1925., samostan je bio zatvoren, dio njegove imovine je prebačen u crkvi Spasitelja na City i drugih hramova. U 1930. odlukom gradskih vlasti Zvonik je srušena i crkva Atanazije i Ćirila i druge monaške zgrada smještena organizaciju, proizvodne radionice, bratska tijelo je služila kao sklonište.

U studenom 2007. godine, hram s ogradom i vrata kule, sveci dali rusku pravoslavnu crkvu. Kada Jaroslavlj teološko učilište preselio u dvorac Vakhromeeva po nalogu samostanske crkve biskup Cyril postao sjemenište. 31. siječnja 2008. u kapeli AleXY je počinio prvi servis.