Arheološki muzej Komotini službeno je osnovan 1962. godine, a temelji se na arheološkoj zbirci, okupio skupinu studenata jednog od gradskih škola, gdje je, u stvari, drevnih artefakata i pohranjeni u godinama 1937-1962. Godine 1962., zbirka smještena u zasebnoj zgradi, ali zbog konstantnog nadopunjavanja riznice Muzeja potrebno hitno proširenje izložbenog prostora. U godinama 1968-1970 posebno za muzej designed by poznatog arhitekta Konstadinidisa Apis novogradnji je izgrađen, koji se danas smatra jednim od najimpresivnijih modernih zgrada u gradu.

Jedinstveni relikvije izloženi u Arheološkom muzeju su prikupljeni tijekom Trakije, a pokrivaju širok vremenski period od neolitika do bizantskog razdoblja, savršeno ilustrira povijest kulture u regiji i naglašavajući neporeciv utjecaj na njega starih Grka. Glavni Izložba uključuje nalaza iz prapovijesnog naselja, grčkih kolonija, rimskih naselja i groblja. Izložba je predstavljena u kronološkom redoslijedu iu skladu s teritorijalnom nadležnošću drevnih artefakata.

Arheološki muzej Komotini, možete vidjeti keramike i bronce, skulpture, nakit, novac, oružje i nadgrobnim artefakata i još mnogo toga. Najvrjedniji stavka u zbirci je svakako zlatna bista rimskog cara Septimije Sever (AD 193-211gg).

Od 1987, Arheološki muzej redovito provodi obrazovne programe za osnovne i srednje škole.
  Danas Arheološki muzej Komotini - jedan od najzanimljivijih znamenitosti grada.