Izgrađena je u 1590-1592 godina stariji židovski grad Mordechai Mayzlom, koji financira opsežnu restrukturiranje geta u stilu Renassans. Sinagoga je izgrađena pod vodstvom Josipa i Judi vratila Goldshmida de Herz. Izvorno zgrada je teško oštećena tijekom požara u 1689., nakon čega je zgrada obnovljena u baroknom stilu. Nakon restrukturiranja u gotička Revival stilu A.Grotta u 1893-1905, sinagoga je izgubio mnogo od obilježja baroka. Od početne raspolaganju očuvana renesansna trobrodnu izgleda glavnog broda i pojačani žensku galeriju.

Trenutno Maisel sinagoga služi kao izložbeni prostor i skladištenje Židovski muzej. Prvi dio izložbe Povijest Židova u Češkoj i Moravskoj iz naselja prije emancipacije ilustrira tijek povijesti Židova u Češkoj iz desetog stoljeća do kraja XVIII stoljeća. Prolog uvodi povijesne podatke o podrijetlu židovskog naselja u Češke i Moravske. Kao pravni i socijalni položaj Židova u srednjovjekovnoj državi. Posebna pozornost posvećuje se renesanse, odnosilo na izgradnju sinagoge, tako ime svoje osnivača Mordyhaya Mayzla. Tradicionalna židovska obrazovanje su djelo istaknutih znanstvenika, koji su zauzeli mjesto rabina i talmudskih škola rektori češki i moravskih židovskim zajednicama (Lib rabin David Oppenheim).