U 1546. je osnovao grad Arica na mjestu zvanom El Chenchorro. Pedeset godina kasnije grad je razoren u potresu i tsunamiju, koji je prisilio stanovnike da se presele svoje domove u luku pod zaštitom Cape Morro, na mjestu gdje je sada.

Sadašnja zgrada katedrale Arica sagrađena na ruševinama drugog hrama u gradu, koji je izgrađen u 1640. Nakon 200 godina staža, ova crkva je također uništena u potresu 1868. godine. Samo očuvana kamenim stubama. Projekt nove crkvene zgrade je naredila peruanskim predsjednikom Jose Balta u francuskom studiju Gustave Eiffel, a izvorno je bio namijenjen odmaralištu Ancón. No, 1875. godine odlučeno je da se izgrade u Arica. Godinu dana kasnije, hram je održao prvu misu.

Tijekom Pacific rata (1879-1883) počeo pripadaju gradu Arica u Čileu. No, do dolaska dvadesetog stoljeća, Arica ostala pod vodstvom biskupije Arequipa, u skladu s uredbom iz Vatikana. U 1910., gradonačelnik grada Arica, Maximo Lira, odredio izgon peruanske svećenika i njegovog pomoćnika iz zemlje. Oni su zamijenjeni čileanskih vojnih kapelana.

Godine 1911. crkva je u prilogu biskupije Tarapaca (sada - biskupije Iquique). I u 1959. premješten je u čin katedrale. Uz blagoslov pape Ivana Pavla II u 1986, on je osnovao biskupiju Arica do centra grada u katedrali Svetog Marka u Arica.

Crkva je relativno mali, u gotičkom stilu. Dizajn crkve je izrađena u cijelosti od metala - greda, stupova, povezani šiljastim lukovima, osim za dva drvena vrata. Kula hrama uzdiže prema nebu, daje ljepotu i raskoš zgrade, koja je pojačana okolni krajolik: Plaza de Colón, Cape Morro de Arica, luke, luke i bezgraničnom moru.

Godine 1984. zgrada katedrale proglašen nacionalnim spomenikom Čilea. I u 2002. godini - povijesni spomenik Arica.